-11-21 根据orthofinder的结果利用单拷贝直系基因建树

单拷贝直系同源基因多序列比对

在orthofinder运行后的结果Single_Copy_Orthologue_Sequences文件夹中有所需要的直系同源基因的序列

for i in *.fa; do linsi $i > $i.1; done

提取保守序列

conda install Gblocksfor i in *.1; do Gblocks $i -t=p -e=

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