由于在黑茶的后发酵工艺中，微生物的参与使茶叶中的生化成分发生了一系列的变化，最终使黑茶在一些物质和它们的含量上都有别于其他的茶类。
茶多糖：
茶多糖是茶叶中活性多糖的总称，在黑茶中，其茶多糖含量最高，活性也最强。黑茶渥堆时的特殊环境是造成黑茶的茶多糖活性优于其它茶类的重要原因。在科学实验中，茶多糖可以使高脂饮食的小鼠的血脂全面降至正常范围，这也证明了茶多糖降血脂的重要作用。
多酚类物质：
从黑茶中可以分离出多种多酚类物质，多酚类物质可以抑制脂肪酸的合成酶，使脂肪酸的合成受限，从而抑制脂肪细胞的形成。而黑茶更丰富的茶多酚物质使其降脂的效果更加优于其他茶类。黑茶的茶多酚可以通过抑制胰脂肪酶的活性使吃进去的食物中脂肪的分解变少，减少人体对脂肪的吸收。不仅如此，其中的没食子儿茶素，还有很强的抑制胆固醇生物合成的作用。
茶色素：
茶色素是以儿茶素为主的多酚类化合物经过氧化而聚合成的。黑茶中的茶褐素物质，可以显着降低高血脂的大鼠血清中胆固醇和血脂的水平，并减少肝脏上脂肪的沉积，预防脂肪肝的形成。
其他的微生物：
这里面主要有冠突散囊菌，茯砖茶在发花过程中形成黄色菌落，俗称金花，金花是茯砖茶，品质重要指标，也是茯砖茶区别于其他黑茶的最主要的特征。有科学家对金花孢子粉进行过研究，发现其对减轻脂肪肝，降低甘油三酯具有很好的作用。
所以黑茶的减脂原理，其主要的作用是能够减少食物脂肪的消化和吸收，阻止体内脂肪细胞的生成，同时促进脂肪在体内的氧化分解以及排出。
由于黑茶是发酵茶，有人可能会怀疑饮用黑茶是否安全呢？尤其是很多人对茯砖茶中的金花也就是冠突散囊菌心存疑虑，经过科学试验证明类冠突散囊菌是完全安全无毒的，不仅如此，这种菌还有调节肠道的作用。
而在黑茶的发酵过程中，并不产生任何有害物质，相反黑茶的提取物，对葡萄球杆菌等多种有害物质反倒有抑制作用。所以人们尽可以放心的饮用黑茶，享受黑茶带来的各种好处。
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