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案例分享 | 基因检测辅助临床诊断罕见病——Aarskog-Scott综合症

时间:2023-08-13 20:37:45

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案例分享 | 基因检测辅助临床诊断罕见病——Aarskog-Scott综合症

临床信息:4岁,男,矮小症;房缺、室缺术后;双侧隐睾;头围偏小(47cm);眼距稍宽;耳位低;远视、散光。家族史:无。

检测项目:送检基源全外显子组测序

检出1个匹配受检者临床表型的致病性基因变异:FGD1基因c.C577T:p.R193X纯合变异(半合子)。

1. FGD1基因关联疾病表型简介

OMIM收录该基因变异关联疾病表型为:

注:“XLR”:X连锁染色体隐性遗传;信息参见:/entry/305400

2. 变异位点解析①本样本中检出变异为导致功能丧失的无义突变(PVS1),该变异位于千人数据库、EXAC数据库、gnomAD数据库正常对照人群中未收录(PM2),该变异已被ClinVar数据库收录,注释为致病性(Pathogenic)。文献报道了在Aarskog-Scott综合征患者中检出该基因其它变异[1]。

②经一代测序验证,该变异在受检者父母样本中均未检出,提示为新发突变(PS2),根据ACMG遗传变异分类标准与指南,上述变异注释为致病性的变异。

3.遗传咨询建议

受检者检出FGD1基因c.C577T:p.R193X纯合变异(半合子)为新发突变,若受检者父母再生育,下一胎再发生该变异的可能性很小(无法排除生殖嵌合)。

4. 一代测序结果受检者:

结果显示该位点为纯合变异(FGD1:NM_004463:exon3:c.C577T:p.R193X)

受检者之父:

结果显示该位点为野生型,无变异(FGD1:NM_004463:exon3:c.C577T:p.R193X)

受检者之母:

结果显示该位点为野生型,无变异(FGD1:NM_004463:exon3:c.C577T:p.R193X)

■■■■■■■一、Aarskog-Scott综合症

Aarskog-Scott综合症(AAS)又名faciodigitogenital syndrome 或是faciogenital dysplasia,一种罕见的X连锁隐性遗传的多系统发育障碍疾病,其特征是颅面畸形,骨骼、生殖器异常,以及不成比例的肢端矮小身材。AAS在1970年被Aarskog 首次描述,并于1971年被Scott 进一步描述,目前文献报道的病例约110例。据估计,Aarskog-Scott综合症的患病率等于或略低于1/25,000。二、体征和症状

AAS主要影响男性,而杂合子携带者女性可能有轻微症状。AAS表现出一系列特征性的面部,骨骼和生殖器异常,具有临床异质性。

面部特征包括:前额宽阔的圆脸、眼距过宽、眼睑下垂、眼睑裂隙向下、前倾的鼻孔、上颌骨发育不全和寡妇发峰(美人尖)等。耳朵异常包括低位耳和增厚肉质耳垂。

牙齿异常包括:出生时牙齿缺失,牙齿萌出延迟以及牙釉质发育不全。

骨骼发育不良包括:不成比例的身材矮小,脊柱异常,短指,手指弯曲,扁平足,漏斗胸,腹股沟疝,肚脐突出等。

有助于做出诊断的标志是生殖器异常,包括鞍状的阴囊或披肩状阴囊、隐睪症、尿道下裂。

一些受影响的男孩已被描述为智力残疾(30%),可能出现一系列轻微的学习困难和/或行为障碍,受影响的儿童可能在婴儿期出现发育迟缓、多动症、注意力缺陷、冲动和对立。发育不良和慢性呼吸道感染也被描述。

另外一些症状可能不常发生,包括先天性心脏缺陷、脊柱侧凸、额外的肋骨对、腭裂、唇裂、手指轻微的蹼状、有或没有带蹼的短脖子。其他眼部异常可能包括斜视、远视和某些眼部肌肉麻痹。

三、原因

已经在约20%的受影响男性中鉴定出FGD1基因突变,因此,尚未鉴定的其他基因可能也与该病症相关。

AAS主要缺陷是FGD1/ Cdc42信号传导异常,导致胚胎发育异常和软骨内膜和膜内骨形成异常。FGD1编码鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),通过特异性激活Cdc42(Rho GTPase细胞分裂周期42),FGD1蛋白刺激成纤维细胞形成丝状伪足,参与细胞信号传导,粘附和迁移的细胞骨架元件。通过Cdc42,FGD1蛋白还激活c-Jun N末端激酶(JNK)信号级联反应,这是一种调节细胞生长,凋亡和细胞分化的途径。四、诊断

家族史、体格检查、FGDY1基因缺陷检测、X射线可鉴别骨骼异常、超声心动图可以检查心脏异常、脑部CT扫描检查囊性发育、腹部超声诊断隐睾等。五、鉴别诊断

Noonan综合征:特征是身材矮小,颅面畸形和先天性心脏病,泌尿生殖系统异常,凝血功能障碍,学习困难或轻度智力障碍等。由许多基因突变引起的,如PTPN11、KRAS、BRAF、MAP2K1、SOS1、RAF1、NRAS、RIT1和SOS2等。

Robinow综合征:特征是出生后生长迟缓导致的轻度至中度身材矮小,颅面畸形,骨骼畸形,生殖器异常等。可能由不同基因的突变引起,如WNT5A、ROR2、DVL3和DVL1等。

LEOPARD综合征:L代表皮肤雀斑(lentigines);E代表心电图异常;O代表眼距过宽;P代表肺动脉狭窄,右心室血流受阻;A代表生殖器异常; R代表发育迟缓导致身材矮小;D代表内耳功能障碍引起的听力损失(感音神经性耳聋)。可能由不同基因的突变引起,如RAF1,BRAF和PTPN11等。参考信息:[1]Orrico, A., Galli, L., Faivre, L., Clayton-Smith, J., Azzarello-Burri, S. M., Hertz, J. M., Jacquemont, S., Taurisano, R., Arroyo Carrera, I., Tarantino, E., Devriendt, K., Melis, D., Thelle, T., Meinhardt, U., Sorrentino, V. Aarskog-Scott syndrome: clinical update and report of nine novel mutations of the FGD1 gene. Am. J. Med. Genet. 152A: 313-318, .[2]/rare-diseases/aarskog-syndrome/[3]/

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