点击上方蓝字关注我们1软件介绍
数量性状受几个主基因和一系列多基因控制。主效基因可以单独识别，多基因可以集体检测，这是主基因+多基因混合遗传模式。将实际数据的频度分布与混合遗传模型的理论分布进行比较，即可得到复杂性状的模型。自20世纪90年代以来，这种被称为“分离分析(SEA)”的方法在我国得到了广泛的应用。为了推广这一方法，章元明老师等开发了R软件SEA。
当前的软件SEA包括14种类型的种群：
SEA是一个运行在R环境下的软件包，可以从https://cran.r-/web/packages/SEA/index.html免费下载。
在R环境下，SEA软件包可以通过以下指令加载出来:
install.packages(pkgs="SEA")
2表型文件
表型文件应该是*.csv格式的文件，所有群体的表型观察结果都包含在一个文件中，每个群体的所有观察结果都列在同一列中(表2.1)
在每一列中，第一个元素必须是标题，代表总体类型，如“F2”、“P1”。
该数据集可以通过单击“Browse”按钮上传到软件SEA中。
3实用操作
点击“Start”,使用下拉菜单选择要分析的群体，使用“Browse”输入数据集文件。一旦一个文件上传成功，结果将如下图所示
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在运行程序之前，在“Model Selection”选项菜单选择Model，“All Models”表示运行此总体下的所有模型。
当目标群体为：F3(F2：3)、BCF(B1：2、B2：2)、G4F3(P1、P2、F1、F2：3)、G3DH(P1、P2、DH)、G5BCF(P1、P2、F1、B1：2、B2：2)、G5(P1、P2、F1、F2、F2：3)、G6F(P1、P2、F1、F2：3、B1：2、B2：2)时，No. of plants in each family相同，均为默认值1。在BIL type中，需要选择BIL类型：BIL1(F1×P1)或BIL2(F1×P2)。
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使用“Run”运行程序，结果将显示在结果模块中，然后可以使用“Download Result”进行下载。
4参考文献
Zhang Yuan-Ming, Gai Junyi. Identification of mixed major genes and polygenes inheritance model of quantitative traits by using DH or RIL population.Acta Genetica Sinica2000, 27(7): 634-640.
Wang Jiankang, Gai Junyi. Identification of major gene and polygene mixed inheritance model and estimation of genetic parameters of a quantitative trait from F2 Progeny.Acta Genetica Sinica1997, 24(5):432-440.
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作者 / 满夏夏
编辑 / 满夏夏
审核 /韩渊怀、张益娟
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