19世纪巴尔干的民族解放运动风起云涌，希腊人民首举义旗，于18宣布独立，但只有经过近艰苦卓绝的斗争，才最终完成独立的大业。1848年，革命浪潮席卷整个巴尔干，罗马尼亚各地都爆发要求独立的起义；同时塞尔维亚也要求建立独立的王国，并试图组成一个包括保加利亚、克罗地亚在内的反土联盟，后来虽然都未成功，但却沉重打击了土耳其在巴尔干的殖民统治。1875年，波黑举行反对土耳其统治的起义，次年塞尔维亚和黑山也向土耳其宣战。1877年4月，俄土战争爆发，在巴尔干各国人民的支援下，俄国迅速取胜。随着俄土战争的结束，罗马尼亚、塞尔维亚、黑山纷纷宣布独立。
保加利亚则在1878年的柏林会议上取得了自治。从此巴尔干进入了一个新的历史时期，然而由于各国统治集团都怀有强烈的民族主义情绪，力图扩大自身的势力范围，再加上欧洲列强的挑拨与干预，于是纷争和战乱也就接踵而至。根据1878年3月所签订的《圣斯特法诺和约》，俄罗斯得以如愿以偿地建立起一个大保加利亚，并把它视为自己在巴尔干地区的支柱。但随后在英、德、奥匈的压力下，孤掌难鸣的俄罗斯只得让步，在6月召开的柏林会议上同意将保加利亚一分为三：巴尔干山脉以北的保加利亚本部为自治公国；巴尔干山脉以南的东鲁米利亚隶属土耳其素丹，由一信仰基督教的总督治理；马其顿地区则仍归属土耳其。
马其顿地区杂居着不同民族，根据塞尔维亚在1899年所作的统计，当地共有6个民族，其中塞族人口最多，约有2048320人；而保加利亚几乎在同时所作的调查却提供一个完全不同的数据，称保加利亚人为1184036名，而塞族仅有700人。如此大的差异令人咋舌，从而引发塞尔维亚和保加利亚之间长期的马其顿之争。1882年，塞尔维亚曾不宣而战，一度攻入保加利亚境内，更激化了彼此间的矛盾。1893年，“马其顿内部革命组织”成立，宣称要为马其顿的独立而斗争，使马其顿问题更显突出。此外，巴尔干各国还积极谋求欧洲大国的支持，纷纷与它们结盟。
1881年，塞尔维亚与奥匈签约，承诺不与他国签订任何条约，不在波黑等地怂恿任何反对奥匈的活动，并在经济上给予奥匈各种特权。1883年，罗马尼亚为从俄国手中夺回比萨拉比亚加入了德奥军事集团。而保加利亚则于1885年在未与欧洲列强打招呼的情况下，突然收回东鲁米利亚，使欧洲吃惊不小。为消除此事引发的不良影响，保加利亚和俄罗斯于1902年签订秘密军事协议，以抵制奥匈和罗马尼亚，随后又与塞尔维亚签约，要求在马其顿进行改革，以缓和两国关系。大国在这种情况下也积极开展活动，在巴尔干寻找盟友，以达到扩张的目的。
1897年，俄国和老冤家奥匈帝国签订协议，划分了两国在巴尔干的势力范围，规定巴尔干的东部归俄国，而其西部（含阿尔巴尼亚）则归奥匈。为取得法国的支持，同年俄国又和法国签订秘密协议，两国商定不让奥匈势力延伸至萨洛尼卡，一旦现状被打破，则都拉斯划归塞尔维亚，而斯库台则成为黑山的首都。波黑和马其顿一样，杂居着穆斯林、克罗地亚和塞尔维亚三个民族，极易引发内部纷争，同时也引来欧洲列强贪婪的目光。在1878年的柏林会议上，波黑划归奥匈管辖，此后一直是奥匈觊觎的对象。
1908年9月，奥匈外交大臣爱伦泰尔和俄国外交大臣伊兹沃尔斯基秘密会晤，私下达成口头协议，即奥匈吞并波黑，而俄国则在黑海海峡取得优势地位，但并未留下书面文件，也未规定何时将该协议付诸实施。10月6日，奥匈却突然宣布吞并波黑，整个欧洲为之愕然，对俄国说来更如晴天霹雳，伊兹沃尔斯基是在去巴黎的火车上得悉这一消息的，顿觉狼狈不堪，却又无可奈何。奥匈悍然吞并波黑激起塞尔维亚人民的无比愤怒，19成立“要么联合，要么死亡”的激进组织，亦称“黑手党”，宣誓要不惜一切，将奥匈逐出南斯拉夫人民居住的土地。
19爆发了意土战争，土耳其在战争中节节受挫，促使巴尔干各国加速联合起来，以便进一步动摇土耳其在巴尔干的殖民统治。193月13日，经过长期接触和谈判，塞尔维亚和保加利亚终于签订了针对土耳其的秘密协定，双方就棘手的马其顿问题达成协议，商定一旦对土战争取得胜利，马其顿的北部归塞尔维亚，其余大部分归保加利亚，至于尚有争议的部分则由俄国沙皇来裁定它最终的归属问题。接着4月29日，两国又签订了军事协议。5月，希腊也和保加利亚签署了针对土耳其的秘密协定；接着，希腊又和塞尔维亚及黑山结盟。这样，除罗马尼亚外，各巴尔干国家终于组成了一个反对土耳其的政治和军事同盟。
1910月8日，黑山首先向土耳其宣战，接着塞尔维亚、保加利亚和希腊也相继投入反土战争。士气低落的土耳其军队无力抵抗，节节败退，只得在12月3日签订停战协定。但土耳其仍心有不甘，于192月重燃战火，不过仍未能逃脱失败的命运，只得再次求和。5月30日签订的伦敦条约使保加利亚陷入极为不利的境地，塞尔维亚据约得到了包括争议地区的马其顿大部分，希腊则夺取了萨洛尼卡。为此，心存不满的保加利亚遂决定用武力来迫使昔日的盟友改变这一现状。196月29日，过高估计自身实力的保加利亚突然向塞尔维亚和希腊发动进攻，开始了第二次巴尔干战争。
保军未能迅速取胜，此时在旁观战多时的罗马尼亚突然加盟塞尔维亚和希腊一边，对保加利亚展开猛攻，土耳其则趁火打劫，对保加利亚宣战。保加利亚顿时四面受敌，只得放下武器求和。198月10日签订的《布加勒斯特和约》使保加利亚蒙受屈辱：马其顿的大部分划归塞尔维亚，其余部分及色雷斯（包括萨洛尼卡）则给了希腊，罗马尼亚得到多布罗加，土耳其则重获亚得里亚堡，得以在巴尔干重新站住脚跟，保加利亚却相形见绌，可说是一无所得。两次巴尔干战争使半岛的形势发生了急剧的变化。首先是塞尔维亚通过战争显示了自己的实力，其领土增至87500平方公里，人口也猛增130万，成为巴尔干的一个强国，因而也成为奥匈的眼中钉，欲先去之而后快。
还在19底，即第一次巴尔干战争爆发后不久，奥匈外交大臣巴尔赫托尔特便公然声称，绝不允许塞尔维亚在亚得里亚海取得一个出海口，并决心建立一个独立的阿尔巴尼亚，以抑制日益强大的塞尔维亚。不久奥匈帝国参谋总长康拉德便在向皇帝弗兰茨·约瑟夫一世上呈的报告中称：“塞尔维亚威信的巩固不仅在巴尔干、在波黑、在达尔马提亚，而且在帝国的内地，都会给帝国的声望带来巨大的打击”，必须认真对待。此外他还曾多次声称，塞尔维亚已成为全体南斯拉夫人联合的中心，直接威胁到奥匈帝国的存在和壮大。为此在19底，奥匈曾在接近塞尔维亚的边境地区集结20万重兵，公开进行挑衅和威胁，此后奥匈和塞尔维亚之间的矛盾便日趋激化。
作为战败国，保加利亚和塞尔维亚相比，恰形成强烈的反差。自19世纪80年代起，保加利亚的统治集团便雄心勃勃，欲在巴尔干地区称霸一方。自1887年至19，保加利亚不断扩军备战，军队人数增加了273％，军费增加了100％，至19已拥有一支84409人的军队，在巴尔干首屈一指。在两次巴尔干战争中，保加利亚都投入重兵，结果却以惨败告终，损失极为惨重，共有5.8万人死亡，10余万人受伤，元气大伤，国际地位也一落千丈。保加利亚统治集团对此深为不满，准备卷土重来，并把塞尔维亚锁定为复仇的对象。两次巴尔干战争期间，在巴尔干地区又诞生了一个新的国家，那就是阿尔巴尼亚。
197月29日，在伦敦召开的欧洲列强大使会议上决定建立一个独立的阿尔巴尼亚，并把它处于英、法、俄、德、意和奥匈六大国的监督之下，为期。塞尔维亚因这个新生的国家堵住了它的出海口而怨气冲天；黑山虽小，但也有野心，试图夺取阿尔巴尼亚的斯库台。这样一来，阿尔巴尼亚的建立不仅没有给巴尔干增添和平的氛围，反而带来了几分不安定的因素。两次巴尔干战争后，奥匈力图通过削弱，甚至摧毁塞尔维亚的途径来扩展自身在巴尔干的势力范围，自然遭到俄罗斯的坚决反对，随后又引发协约国和同盟国在此的冲突，为第一次世界大战的爆发埋下了祸根。
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