PCA(Principal Components Analysis)即主成分分析,也称主分量分析或主成分回归分析法,是一种无监督的数据降维方法
首先利用线性变换,将数据变换到一个新的坐标系统中;然后再利用降维的思想,使得任何数据投影的第一大方差在第一个坐标(称为第一主成分)上,第二大方差在第二个坐标(第二主成分)上。这种降维的思想首先减少数据集的维数,同时还保持数据集的对方差贡献最大的特征,最终使数据直观呈现在二维坐标系。
sklearn.decomposition.PCA(n_components=None, copy=True, whiten=False)
import matplotlib.pyplot as pltfrom mpl_toolkits.mplot3d import Axes3Dfrom sklearn import datasetsfrom sklearn.decomposition import PCA# import some data to play withiris = datasets.load_iris()X = iris.data[:, :2] # we only take the first two features.y = iris.targetx_min, x_max = X[:, 0].min() - .5, X[:, 0].max() + .5y_min, y_max = X[:, 1].min() - .5, X[:, 1].max() + .5plt.figure(2, figsize=(8, 6))plt.clf()# Plot the training pointsplt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=y, cmap=plt.cm.Set1,edgecolor='k')plt.xlabel('Sepal length')plt.ylabel('Sepal width')plt.xlim(x_min, x_max)plt.ylim(y_min, y_max)plt.xticks(())plt.yticks(())# To getter a better understanding of interaction of the dimensions# plot the first three PCA dimensionsfig = plt.figure(1, figsize=(8, 6))ax = Axes3D(fig, elev=-150, azim=110)X_reduced = PCA(n_components=3).fit_transform(iris.data)ax.scatter(X_reduced[:, 0], X_reduced[:, 1], X_reduced[:, 2], c=y,cmap=plt.cm.Set1, edgecolor='k', s=40)ax.set_title("First three PCA directions")ax.set_xlabel("1st eigenvector")ax.w_xaxis.set_ticklabels([])ax.set_ylabel("2nd eigenvector")ax.w_yaxis.set_ticklabels([])ax.set_zlabel("3rd eigenvector")ax.w_zaxis.set_ticklabels([])plt.show()
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