如何获得基因序列——在NCBI中查找目的基因实例
如何获得基因序列?——在 NCBI 中查找目的基因实例
如何获得基因序列?——在 NCBI 中查找目的基因实例
基因,即具有遗传效应的 DNA 片段,是控制生物性状的基本遗传单位。基因有两个特
点,一是能忠实地复制自己,以保持生物的基本特征;二是基因能够“突变”,突变绝大多数
会导致疾病,因此研究某种疾病的病理要从基因开始,研究基因当然就要知道该基因序列了,
如何查找基因就是关键问题了,这里,我们将举例详细讲解一下如何查找基因。
1. 首先可以根据文献获得目的基因序列
通过阅读文献,找到你感兴趣的基因,根据文中提到的该基因在 NCBI 中的 ID 号,直
接打开 , 在 All Databases 后的下拉框中选择 Nucleotide ,把基
因 ID 号输入 Search 前面的文本框中,点 “Search”,就可以找到该基因了。
举例说明,例如:在 年 JBC 的文章 (Conditional Knock-out of Integrin-linked Kinase
Demonstrates an Essential Role in Protein Kinase B/Akt Activation )中出现了 “calreticulin
(GenBank accession number gi ”,那么把输入 Search 前面的文本框中,
点 “Search”,就可以找到该基因了 (当然包括基因序列等相关信息),见下图。
检索结果界面如下图,可以看到 GenBank 号为 AY047586 的CALR 基因的相关信息了。
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汉恒生物科技(上海)有限公司 400-092-0065
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实验室:上海市张江高科技园区张江药谷孵化器 1 号楼 314 汉恒生物科技
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如何获得基因序列?——在 NCBI 中查找目的基因实例
里面有很多基因的信息,再往下是基因的的核酸序列 (ORIGIN 之后)。
基因的翻译区 (CDS )点击 CDS 即可得到。
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如何获得基因序列?——在 NCBI 中查找目的基因实例
下图标示的褐色区域序列即为基因的编码区序列。
这里需要指出一下,在显示基因的页面右下侧有一个 LinkOut to external resource,里
面是与该基因相关的链接,对于该基因的相关研究是很有用的。
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