西湖大学鞠峰组招聘环境微生物组与抗生素耐药生态方向博士后
一、西湖大学简介
西湖大学是一所社会力量举办、国家重点支持的非营利性的新型高等学校,于2月14日获教育部批准成立。学校按照高起点、小而精、研究型的办学定位,致力于集聚一流师资、打造一流学科、培育一流人才、产出一流成果,努力为国家科教兴国和创新驱动发展战略、建设高水平研究型大学作出突出贡献。
图1 西湖大学在建云谷校区(将于9月后启用)
施一公校长寄语:我们期望,十年、二十年以后,在浙江杭州,有一所在世界上备受尊崇的、立足中国大地而又充满中国特色的高等学府,西湖大学。这里,将拥有世界上最杰出的一批科学家,培养最优秀的青年人才,从事最尖端的基础和应用研究,探索适合中国国情的科研教育体制机制,为中国的高科技可持续发展提供强大的引擎和支撑,为世界文明作出无愧于中华民族的贡献!
二、课题组简介
微生物是地球上最丰富的生命体,在环境、生物经济和人类系统中扮演着至关重要的角色。宏基因组学是通往未知微生物界大门的钥匙,近年来被广泛应用于发现新物种、新基因、新的物质与能量代谢,为微生物组技术、生物资源发掘、污染修复微生物组学、微生物群落生态学、生命起源与进化等领域开拓性研究与发现提供强有力的方法学支撑。西湖大学环境微生物组与生物技术实验室(EMBLab)已经建立了微生物组学与宏基因组学所需的一系列生物信息学与分子生物学方法与技术平台,研究兴趣包括:1)生物修复与资源化微生物组工程;2)抗生素耐药性产生与传播机制;3)新型水环境微污染物(塑料、药物、藻毒素等)的降解转化及健康效应;4)微生物群落构建机制与基因资源挖掘;主要的研究方法与支撑平台包括:宏基因/转录/蛋白组学、常规分子生物学、基因编辑技术、高性能超算服务器、高分辨液相/气相-质谱联用平台、DNA/RNA-SIP技术、第二代/三代测序数据分析平台、生物信息学计算服务器、超算中心、先进3D-打印平台、液滴微流控技术、生物反应器装置、常规理化生表征平台(如电镜、核磁、拉曼光谱、流式细胞仪)等。实验室主页链接:www.ju-/
图2 西湖大学EMBLab实验室集体合影(拍摄于5月)
三、招聘岗位
环境微生物组与抗生素耐药生态方向博士后2 名
1、研究方向
【环境微生物组学】方向:将液滴微流控芯片、拉曼光谱筛选、流式分选、稳定同位素探针等技术与宏基因/转录/蛋白组学或单细胞测序的耦合技术应用于“探索环境微生物群落构建机制”、“解析不可培养微生物功能”或“实现高通量微生物培养组”任一方向;
【抗生素耐药生态学】方向:“抗生素耐药性/病原菌/抗菌剂的检测新方法与技术平台研发(如生物传感器、三代测序耦合检测平台)”或“抗生素耐药在环境中产生与传播机制的基础研究”任一方向。
2.应聘条件
1)年龄不超过40周岁;已取得或即将取得博士学位;
2)申请人需要在【环境微生物组学】或【抗生素耐药生态学】领域已具备良好的专业基础与前期学术积累,在领域前沿期刊发表学术论文2篇或以上;
3) 热爱科研、善于独立思考;良好的英文写作能力、沟通能力、高度的责任心及较强的团队合作精神;
4)与课题组长共同制定研究计划,开展课题研究;
5)协助课题组博士研究生合作培养。
3、薪酬待遇
根据个人科研工作能力和博士后有关规定从优发放。课题组将提供稳定的工作环境与一流的研究平台,协助申报博士后相关项目,并根据兴趣与需求支持个人的职业发展。
对获得中国博士后科学基金资助和省级博士后科研项目资助的,市财政给予1:1配套资助。对出站留杭(来杭)工作的博士后,给予每人40万元补助。
四、你会得到什么
成功的应聘者会得到以下独特的机会:
1) 学习、掌握微生物组学相关研究方法;
2) 丰富的微生物组测序数据以及经验丰富的合作者;
3) 稳定、开放、愉悦的工作环境与一流的科研平台支持;
4)国际与国内学术会议交流的机会;
5) 有竞争力的工资待遇(面议);
6)享受政府对来杭工作博士后以及出站留杭工作博士后的支持和补助政策。
五、报名时间及应聘方式
1、报名时间
招满即止,有意应聘者请从速投递应聘材料。
2、应聘方式
请将以下材料以一个PDF形式发送至邮箱: jufeng@,邮件标题请注明:“应聘岗位名称+本人姓名”,对于符合要求并通过初审者,我们将会在1个月内通过电话或邮件通知安排面试。
1)个人简历:含学习与工作经历、发表论文、研究兴趣等;
2)提供不少于 2 名推荐人的联系方式或推荐信;
3)学历学位证明材料。
4)创新研究计划或设想(选择性提供)
附、 课题组代表性论文或专著
1. HL Zhang, NJ, Zhou, Ju F*. . Immunoreaction-based sensors to improve bacterial detection. Handbook of Biochips. Springer. ISBN: 978-1-4614-6623-9
2. Ju F, Beck K, Yin X, McArdell Christa, Singer H, Johnson D, Zhang T, Buergmann H. . Wastewater treatment plant resistomes are shaped by bacterial composition, genetic exchange and up-regulated expression in the effluent.TheISMEJournal13, 346-360.
3. Hu WC, Liang JS, Ju F, Wang QJ, Liu RP, Bai YH, Liu HJ, Qu JH, . Metagenomics unravels differential microbiome composition and metabolic potential in rapid sand filters purifying surface water versus groundwater. Environmental Science & Technology. , 54, 8, 5197-5206
4. Ju F, Zhang T. . Advances in meta-omics research on activated sludge microbial community. Microbiology China, , 46(8): 2038-2052 (in Chinese)
5. Jiang XT, Ye L,Ju F, Wang YL, Zhang T. . Toward an intensive longitudinal understanding of activated sludge bacterial assembly and dynamics.Environmental Science & Technology.52 (15), 8224-8232
6. Ju F,Lau, F, Zhang T. . Linking microbial community, environmental variables and methanogenesis in anaerobic biogas digesters of chemically enhanced primary treatment sludge. Environmental Science & Technology. 51 (7), 3982-3992
7. Hu AY,Ju F, Hou LY, Li JW, Yang XY, Wang HJ, Mulla SI, Sun Q, Bürgmann H, Yu CP. . Strong impact of anthropogenic contamination on the co-occurrence patterns of a riverine microbial community.Environmental Microbiology.19(12):4993-5009
8. Ju F, Li B, Ma LP, Wang YB, Huang DP, Zhang T. . Antibiotic resistance genes and human bacterial pathogens: co-occurrence, removal, and enrichment in municipal sewage sludge digesters.Water Research.91, 1-10
9. Ju F, Zhang T. . Bacterial assembly and temporal dynamics in activated sludge of a full-scale municipal wastewater treatment plant.The ISME Journal. 9: 683-695
10. Ju F, Zhang T. . Experimental design and bioinformatics analysis for the application of metagenomics in environmental sciences and biotechnology.Environmental Science & Technology. 49(21), 12628-12640
11. Li B#,·Ju F#,·Cai L ,·Zhang T. . Profile and fate of bacterial pathogens in sewage treatment plants revealed by high-throughput metagenomic approach.Environmental Science & Technology.49 (17), 10492–10502 (#equal contribution)
12. Li B, Yang Y, Ma LP,Ju F, Guo F, Tiedje J. Zhang T. . Metagenomic and network analysis reveal wide distribution and co-occurrence of environmental antibiotic resistance genes.The ISME Journal.9(11):2490-2502
13. Ju F, Xia Y, Guo F, Wang ZP, Zhang T. . Taxonomic relatedness shapes bacterial assembly in activated sludge of globally distributed wastewater treatment plants.Environmental Microbiology. 16(8):2421-2432
14. Peng XX, Guo F,Ju F, Zhang T. . Shifts in the microbial community, nitrifiers and denitrifiers in the biofilm in a full-scale rotating biological contactor.Environmental Science & Technology.48(14): 8044-8052
15. YangY, Li B,Ju F, ZhangT. . Exploring variation of antibiotic resistance genes in activated sludge over a four-year period through a metagenomic approach.Environmental Science & Technology. 18(47),10197-10205
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学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”
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