#数据集概览
1首先geo发现 里面并没有meta信息
2 并且使用r下载之后,矩阵里面也没有meta信息。
3但是下载文章阅读之后 发现差异分析deseg2的时候 是需要meta信息 消除批次 年龄 实验方法这些因素影响的。
4但是作者说method实验方法对差异分析结果有影响
5 那么接下来,就去更原始的地方(Accession PRJNA634074; GEO: GSE150910)去找下meta信息,如果找不到,就不好办了
getwd()setwd("G:/r/duqiang_IPF/GSE150910_IPF_Donors_subsets/")
打开下载的矩阵csv文件,可见:
duqiang_1分析GEO数据库差异基因(GSE150910) 将差异基因与泛素化酶相关基因取交集。 这个差异分析ipf chp control
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