1、本质不同
植物酒曲，其本质之一就是粗酶制剂。但植物酒曲的最大缺点是酶活较低。现代，由于酶制剂工业的发展，在酒的生产过程中，适当加入一部分酶制剂以代替部分植物酒曲。
甜酒曲为糖化菌及酵母制剂，其所含的微生物主要有根霉、毛霉及少量酵母。
2、发酵过程不同
植物酒曲，在经过强烈蒸煮的白米中，移入曲霉的分生孢子，然后保温，米粒上便会茂盛地生长出菌丝，此即酒曲。曲霉产生的淀粉酶会糖化米里面的淀粉，因此，自古以来就有把它和麦芽同时作为原料糖，用来制造酒、甜酒和豆酱等。用麦类代替米者称麦曲。
甜酒曲，在发酵过程中糖化菌首先将糯米中的淀粉分解成葡萄糖，蛋白质分解成氨基酸，接着少量的酵母又将葡糖糖经糖酵解途径转化成酒精。这样就制成了香甜可口、营养丰富的甜酒酿
3、用途不同
现代酒曲仍广泛用于黄酒，白酒等的酿造。在生产技术上，由于对微生物及酿酒理论知识的掌握，酒曲的发展跃上了一个新台阶。原始的酒曲是发霉或发芽的谷物，人们加以改良，就制成了适于酿酒的酒曲。
植物酒曲和安琪甜酒曲区别
植物酒曲和安琪曲酒曲的区别：
植物酒曲是用植物中草药做成的，安琪酒曲是用原酒发酵做成的。甜酒酿最好选用酒酿专用的甜酒曲，这种酒曲的主要就是用来制作甜酒酿，它和酿酒专用的酒曲是有所区别的。
甜酒曲是糖化菌及酵母菌的混合制剂，主要含有根霉、毛霉及少量酵母等微生物，而酿酒专用的酒曲则含有大量的酵母菌，这是两者最大的区别。
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