抗体的轻链有kappa和lambda两个型别,其中lambda链根据其C区氨基酸的差异,又可以分为四个亚型(subtype)。而且Balb/c和C57BL/6J小鼠的四个亚型在DNA序列上存在巨大差异。在获取抗体基因,构建CAR-T的过程中要十分注意。下图描绘了胚系基因中kappa和lambda轻链基因的组织结构。
Lambda轻链Lambda基因家族由4个C区基因,和大约30 个V区基因,每个V区基因都由两个外显子组成,一个(L)编码前导区,另一个(V)编码大部分可变区。每个C基因的上游都有一个附加的外显子,称为J。L,V,J和C外显子由内含子分隔(插入非编码序列)。
Kappa轻链Kappa轻链基因家族中只包含一个C区基因。V区基因很多(约250个),每个基因都有一个前导外显子和一个V外显子。在Kappa基因家族中,有几个J外显子位于V和C基因之间。所有外显子均被内含子隔开。
IgLc1(exon 1)
C57BL/6J
CTAGGAACAGTCAGCACGGGACAAACTCTTCTCCACAGTGTGACCTTCATGAGTGACCTGGCAGCTGTAACTGCTATGCCTTTCCCATGCTCTTGCTGTCAGGGTCAGGTAGCTGCTAGCCATGTACTTGTTGTTGCTCTGTTTGGAAGGCTGGGTTGTCTCCATACCCTGAGTGACAGGGGTACCATCTACCTTCCAGTCCACTGTCACCACACCTGGGTAGAAATCAGTGATCGTACACACCAGTGTGGCCTTGTTAGTCTCGAGCTCTTCAGAGGAAGGTGGAAACAGGGTGACTGATGGCGAAGACTTGGGCTGGC
BALB/c
GCCAGCCCAAGTCTTCGCCATCAGTCACCCTGTTTCCACCTTCCTCTGAAGAGCTCGAGACTAACAAGGCCACACTGGTGTGTACGATCACTGATTTCTACCCAGGTGTGGTGACAGTGGACTGGAAGGTAGATGGTACCCCTGTCACTCAGGGTATGGAGACAACCCAGCCTTCCAAACAGAGCAACAACAAGTACATGGCTAGCAGCTACCTGACCCTGACAGCAAGAGCATGGGAAAGGCATAGCAGTTACAGCTGCCAGGTCACTCATGAAGGTCACACTGTGGAGAAGAGTTTGTCCCGTGCTGACTGTTCCTAG
IgLc2(exon1)
C57BL/6J
TTAGAGACATTCTGCAGGAGACAGACTCTTCTCCACAGTGTCCCCTTCATGTGTAACTTGACAGGTAAAACTGTTGTGAGATCTCCACTGGTCCGATGTCAAATGTAGGAAGCTGCTGGCCATGAACTTGTTGCCCTCTTTGGTGGGATTTGAAGTGTCCACACCCTGGGTGATAGGTGTACCATTTGCCTTCCAGGCCACTGTCACACCACTCGGGGAAAAGTTGGAAATCAGACACACCAGTGTGGCTTTGTTTTCCTTGAGCTCCTCAGAGGAAGGTGGAAACACGGTGAGAGTGGGAGTGGACTTGGGCTGAC
BALB/c
GGTCAGCCCAAGTCCACTCCCACTCTCACCGTGTTTCCACCTTCCTCTGAGGAGCTCAAGGAAAACAAAGCCACACTGGTGTGTCTGATTTCCAACTTTTCCCCGAGTGGTGTGACAGTGGCCTGGAAGGCAAATGGTACACCTATCACCCAGGGTGTGGACACTTCAAATCCCACCAAAGAGGGCAACAAGTTCATGGCCAGCAGCTTCCTACATTTGACATCGGACCAGTGGAGATCTCACAACAGTTTTACCTGTCAAGTTACACATGAAGGGGACACTGTGGAGAAGAGTCTGTCTCCTGCAGAATGTCTCTAA
IgLc3(exon1)
C57BL/6J
TTAGAGACATTCTGCAGGAGACAGACTCTTCTCCACAGTGTCCCCTTCATGTGTAACTTGGCAGGTAAAACTGTTGTGAGATCTCCACTGGTCCGATGTCAAATGTAAGAAGCTGCTGGCCATGTACTTGTTGTCCTCTTTGGTGGGATTTGAAGTGTCCACACCCTGGGTGATAGGTGTACCATTTGCCTTCCAGGCCACTGTCACACCACTTGGGGAAAAATTGGAAATCAGACACACGAGTGTGGCTTTGTTTTCCTGGAGCTCCTCAGGGGAAGGTGGAAACATGGTGAGTGTGGGAGTGGACTTGGGCTGAC
BALB/c
GTCAGCCCAAGTCCACTCCCACACTCACCATGTTTCCACCTTCCCCTGAGGAGCTCCAGGAAAACAAAGCCACACTCGTGTGTCTGATTTCCAATTTTTCCCCAAGTGGTGTGACAGTGGCCTGGAAGGCAAATGGTACACCTATCACCCAGGGTGTGGACACTTCAAATCCCACCAAAGAGGACAACAAGTACATGGCCAGCAGCTTCTTACATTTGACATCGGACCAGTGGAGATCTCACAACAGTTTTACCTGCCAAGTTACACATGAAGGGGACACTGTGGAGAAGAGTCTGTCTCCTGCAGAATGTCTCTAA
IgLc4
C57BL/6J
CTAGGAACACTCAGCACGGGACAAACTCTTCTCCACAGTGTTCCCTTCATGAGTGACATGGCAGCTGTAACTGCTATGAGATTCCCACGCTTCTGCTGTGAAGAGCAGGTAACTGCTAGCCATGTTGTCCCTCTGTTTGGGAGGCTGGGTAGTCTCTACACCCTGAGTGAAAGGGGTACCATCTGCCTTCCAGGCCACTCTCACAGCAGCTGCGTAGAACTCAGTGATCATACACACCAGTGTGGCCTTTTTAGTCTTGAGCTCTTCAGAGGAAGGTGGGAACAGATTAACTGAGGGTGTAGCCTTGGGTTGGC
BALB/c
AGGCCAACCCAAGGCTACACCCTCAGTTAATCTGTTCCCACCTTCCTCTGAAGAGCTCAAGACTAAAAAGGCCACACTGGTGTGTATGATCACTGAGTTCTACGCAGCTGCTGTGAGAGTGGCCTGGAAGGCAGATGGTACCCCTTTCACTCAGGGTGTAGAGACTACCCAGCCTCCCAAACAGAGGGACAACATGGCTAGCAGTTACCTGCTCTTCACAGCAGAAGCGTGGGAATCTCATAGCAGTTACAGCTGCCATGTCACTCATGAAGGGAACACTGTGGAGAAGAGTTTGTCCCGTGCTGAGTGTTCCTAG
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