Lnc2Meth(http://www.bio-/Lnc2Meth/)是基于已有发表文献结果,对其中涉及到在特定研究疾病中的lncRNA及其甲基化结果进行了整理归纳。因此,对于想从lncRNA和甲基化这两个方面去做研究的小伙伴来说,是一个非常有用的数据库。
在该数据库进行信息检索当然需要一定的信息,主要有两个,一个是lncRNA,一个是某个疾病。只要这两个信息中的任何一个输入,进行检索,就可以拿到相关的信息:
比如,小编想知道肺癌相关的lncRNA及其甲基化情况,输入“lung cancer”即可。
可以看到,在数据库中,收录的和肺癌相关的即是lncRNA,又有相关甲基化信息的共有8个。其中,对于每一个lncRNA会提供DNA甲基化区域,类型和调控机制,是否在文献报道中有作为诊断分子,发表文献信息等都有整理。
如果想知道具体的信息,可以在“detail”中进入即可:
可以看到,lncRNA的基本注释信息,有关这个lncRNA的“Regulation Partner/Target”都会有记录。有关这个lncRNA与甲基化相关的具体功能信息和来源文献,验证方法也都有详细的整理。
除了直接的检索之外,该网站还可以直接对lncRNA和甲基化位点对应信息进行了整理,可以在“DMBrowser”上进行检索:
从上图可以看到,HOTAIR-001的基因组信息以及对应的甲基化位点信息都直观地展示出来了。
该数据应该说是目前唯一一个把lncRNA和甲基化化信息进行关联和整理的比较好的数据库。除了上面的主要内容之外,该网站工具栏中还提供了信息重注释等,小伙伴们,你们还在等什么。
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