不可否认，lncRNA是继microRNA以后的大热点，这一点从文章和基金等都能看出来，那么，从研究microRNA过渡到lncRNA研究时要注意什么？关于这一点，要从十年前说起了，那时的科研热点是microRNA，所以大家有很多课题都是microRNA与疾病关系的，而microRNA的作用机制，特别是对靶基因的调控机制研究套路是非常模块化的。所以，当microRNA这一短链非编码RNA的热点渐渐消退的时候，大家把注意力放到了microRNA的大哥——lncRNA上来，同为非编码RNA，lncRNA就自然成了大家追逐的新宠儿，后来大家把注意力放到了环状RNA上来。
实际上，不管是lncRNA还是环状RNA，大家都面临一个问题：怎么把课题顺利的从microRNA研究过渡到lncRNA/circRNA?
所以，当知道存在七伤拳这种“杀敌一千，自损八百”的作用模式（microRNA可以以类似调控靶基因的方式调控lncRNA，而lncRNA又可能作为microRNA sponge结合microRNA）后，大家开心的笑了，这也是为什么大家做lncRNA就想起来ceRNA作用机制的原因（不懂的看文章：）。
不过ceRNA的作用机制实在是太经典了，大家常忽略非常重要的一点：lncRNA的分子定位。关于lncRNA的分子定位，很多人是想不到要做的，为什么说定位非常重要呢？因为这一点决定了lncRNA可能适用的作用机制。
展开来说，我们知道lncRNA发挥调控机制分为转录水平和转录后水平。转录是发生在细胞核内的，我们知道的ceRNA是发生在胞浆内的转录后调控，所以，当你在决定用ceRNA这一机制的时候，是否考虑过lncRNA(mRNA)定位在胞浆里面？
实际上，不仅是lncRNA，分子定位的明确对于我们确定课题的研究方向是非常关键的，一个分子定位于胞浆、胞核、胞膜还是胞外，能帮我们很大程度的确定后面课题的研究方向，排除不可能的思路。所以，当lncRNA定位于核内的时候，就暂时不要考虑ceRNA了。
这里顺便提一下，我们在做RNA-seq的时候，常常对lncRNA的靶基因进行预测，一般预测的原理也是基于lncRNA-microRNA-mRNA的序列结合原理，所以，当lncRNA不是定位于胞浆的时候，以这种方式预测的靶基因还可以用吗？
当然，延伸出来，有个有意思的问题：如果一条lncRNA在胞浆和胞核内都存在呢？有没有可能？当然是有可能的！我们可以这么考虑：lncRNA X定位于细胞核，在转录水平通过结合某核内因子Y调控Z基因转录；
lncRNA X 出核到胞浆，在转录后水平通过ceRNA等（比如lncRNA-mRNA结合后提高mRNA稳定性的方式）方式上调Z基因mRNA水平。
当然，lncRNA出核后调控的也可以不是Z基因，而是介导Z基因效应相同、相反、平行的基因。比如lncRNA在核内促进Z基因转录，促进细胞增殖；lncRNA在核外抑制Z基因下游基因S的mRNA降解，促进或者抑制细胞增殖、迁移、上皮间质转化等等，而我们知道细胞增殖与迁移、EMT是归到肿瘤转移这一个主题范围的。
显然，上面的假说中有个问题：lncRNA X的出核机制，也就是lncRNA的定位变化，而这也可以成为一个课题：miR-494调节肝缺血再灌注损伤中HIF-1α胞内重定位的机制研究
ITSN1-S蛋白的胞浆/胞核异位表达在乳腺癌中的临床意义及其入核调控分子机制的研究
KPNA2通过运输c-Myc蛋白入核促进上皮性卵巢癌转移的机制研究
14-3-3ε通过转运hnRNP C1/C2出核调控CRC细胞自噬的研究
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