疾病分外感与内伤，外感分三个大类，即伤寒、温病与疫病。
伤寒即仲景所着《伤寒论》所说，外中于风风伤卫，与外伤于寒寒伤营，以及后续传经、坏病、入腑、入脏等。《伤寒论》是以六经的方法，求其疾病形证以调治。
温病分为温热与湿温两类。温病是内有伏气，外遇新感，发病时，新感引动伏气，里应外合，发而为病，是谓温病，没有伏气的不是温病。
温热病是冬伤于寒，伤其太阳蛰藏之令，影响金收水藏，致君相之火不能尽敛癸水，造成冬不藏精。至来春气令由闭藏转为疏泄，出现相火炎升，从内向外而发，致春必病温。
湿温病是其内原有湿热，后外遇新感，内外合邪，发而为病。湿温的伏气多关乎太阴肺脾，或湿热蕴遏胸肺，或湿热隐伏膜原。
疫病分为温疫与寒疫。传染者是疫病，不传染者不是疫病。疫病内原无热，是运气使然。温疫的发生是其年木火不得发泄，寒疫的发生是其年金水不得收藏。
温病与其他疾病的区别：凡是“内原有热”的外感热病，发病是新感引动伏邪，都是温病。内原无热的外感病，包括伤寒、中风、新感热伤风、内原无热的暑温、温疫以及寒疫都不是温病，虽然它们中间大部分发热很高，程度剧烈。
疫病与其他疾病的区别：凡是具有传染性的都是疫病，包括温疫与寒疫。不传染者是其他病，包括伤寒、中风与温病。凡病邻里村乡相传，老少症状相似，其小者，如眼睛红、腮颐肿痛、一起感冒咳嗽等，虽然症状小但是传染，所以是疫病。其大者，起势迅猛，一发莫制，人群相染，症状剧烈，甚至朝发夕死，这就是俗称的瘟疫了。
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