说明人体的生理功能
对于人体的生理功能，中医学也是用阴阳学说来加以概括说明的。认为人体的正常生命活动，是阴阳两个方面保持着对立统一的协调关系的结果。如以功能与物质相对而言，则功能属于阳，物质属于阴，物质与功能之间的关系，就是这种对立统一关系的体现。人体的生理活动是以物质为基础的，没有物质的运动就无以产生生理功能。而生理活动的结果，又不断促进着物质的新陈代谢。人体功能与物质的关系，也就是阴阳相互依存，相互消长的关系。如果阴阳不能相互为用而分离，人的生命也就终止了，所以说：“阴平阳秘，精神乃治；阴阳离决，精气乃绝。”(《素问·生气通天论》)
说明人体的病理变化
人体内外、表里、上下各部分之间，以及机体的物质与物质、功能与功能、功能与物质之间，必须经常保持其相对的阴阳协调关系，才能维持正常的生理活动。因此阴阳的相对协调是健康的表现；疾病的发生及其病理过程，则是因某种原因而使阴阳失却协调所致。
阴阳是互根互用的，又是互为制约消长的，所以阴阳失调就会导致阴阳的偏盛偏衰而发生疾病。但疾病的发生发展关系到正气和邪气两个方面。正气，实质上即是指整个机体的结构与功能包括人体对疾病的抵抗力等；邪气，泛指各种致病因素。正气和邪气，均可以阴阳来区分其属性；它们之间的相互作用、相互斗争的情况，皆可用阴阳的消长失调，即偏盛偏衰来概括说明。正气分阴阳，包括阴液和阳气两部分；邪气亦有阴邪和阳邪之分，如六淫致病因素中的寒、湿为阴邪，风、暑、热(火)、燥为阳邪。疾病的过程，多为邪正斗争的过程，其结果则引起机体的阴阳偏胜偏衰，所以无论疾病的病理变化如何复杂，都不外乎阴阳的偏胜偏衰。
(1)阴阳偏胜 即阴胜、阳胜，是属于阴或阳任何一方高于正常水平的病变。(《素问· 阴阳应象大论》指出：“阴胜则阳病，阳胜则阴病。阳胜则热，阴胜则寒。”
阳胜则热，阳胜则阴病：阳胜一般是指阳邪致病，是阳的绝对亢盛；但阳长则阴消，阳偏胜必然要导致伤阴，故说阳胜则阴病。
“阳胜则热”，是指因阳邪所致疾病的性质而言；“阳胜则阴病”，是指伯胜的病变必然损伤人体的阴液。
阴胜则寒，阴胜则阳病：阴胜一般是指阴邪致病，是阴的绝对偏盛，但阴长则阳消，阴偏胜必然要导致阳衰，故说阴胜则阳病。
“阴胜则寒”，是指因阴邪所致疾病性质而言；“阴胜则阳病”，则是指阴胜的病变必然损伤人体的阳气。
(2)阴阳偏衰 即阴虚、阳虚，是属于阴或阳任何一方低于正常水平的病变。《素问· 调经论》指出：“阳虚则外寒，阴虚则内热。”根据阴阳动态平衡的原理，阴或阳任何一方的不足，必然导致另一方相对的亢盛。
阳虚则寒：阳虚是人体的阳气虚损，阳虚不能制约阴，则阴相对的偏盛而出现寒象，所以称“阳虚则寒”。
阴虚则热：阴虚是人体的阴液不足，阴虚不能制约阳，则阳相对的偏亢而出现热象，所以称“阴虚则热”。
综上所述，尽管疾病的病理变化复杂多端，但均可用阴阳失调(偏胜偏衰)来概括说明。 “阳胜则热，阴胜则寒；阳虚则寒，阴虚则热”，是中医学的病机总纲。
阳损之阴，阴损及阳，阴阳俱损：根据阴阳互根的原理，机体的阴或阳任何一方虚损到一定程序，必然导致另一方的不足。阳虚至一定程度时，因阳虚不能化生阴液，而同时出现阴虚的现象，称“阳损及阴”。同样，阴虚至一定程度时，因阴虚不能化生阳气，而同时出现阳虚的现象，称“阴损及阳”。“阳损及阴”或“阴损及阳”，最终导致“阴阳两虚”。阴阳两虚并不是阴阳的对立处于低水平的平衡状态，同样存在着偏于阳虚或偏于阴虚的不同。
(3)阴阳的转化 人体阴阳失调而出现的病理现象，还可以在一定的条件下，各自向相反的方向转化，即阳证可以转化为阴证，阴证可以转化为阳证。所谓“重寒则热，重热则寒”、 “重阴必阳，重阳必阴。”(《素问·阴阳应象大论》)
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