水是人体主要的组成部分，人体的一切生理活动，如输送营养、调节温度、排泄废物等都要靠水来完成。人喝了被污染的水体或吃了被水体污染的食物，就会对健康带来危害。
饮用水中氟含量过高，会引起牙齿珐斑及色素沉淀，严重时会引起牙齿脱落。相反含氟量过低时，会发生龋齿病等。当人畜粪便等生物性污染物管理不当也会污染水体，严重时会引起细菌性肠道传染病，如伤寒、霍乱、痢疾等，也会引起某些寄生虫病等。19世纪欧洲一些城市由于饮水不清洁，时常发生霍乱，1882年德国汉堡市由于饮水不洁，导致霍乱流行，死亡7500多人。水体中还含有一些可致癌的物质，农民常常施用一些除草剂或除虫剂，如苯胺、苯并芘和其他多环芳烃等，它们都可进入水体。这些污染物可以在悬浮物、底泥和水生生物体内积累，若长期饮用这样的水，就可能诱发癌症。据统计，水污染引发的癌症死亡率20世纪90年代比30年前高出1.45倍。
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