花叶型症状多发生在辣椒前期，基本上是在苗期及幼果期形成之前发生严重，叶片会出现浓绿和淡绿相间的花叶或斑驳，随着病情的发展，病叶逐渐皱缩和卷曲，尤其以植株顶部嫩叶最为明显。坏死型症状多发生中后期，病株部分组织坏死，表现为斑点、条斑、顶枯、坏死斑驳，严重时会造成落叶、落花、落果现象的发生，甚至整株枯死。黄化型表现为病叶明显变黄，形成上黄下绿，植株矮化并伴有明显的落叶。畸形型表现为病株变形，出现畸形现象，如叶片变成线形叶，即蕨叶，或植株矮小，分枝多，呈丛枝状。
辣椒花叶、条斑病毒病主要表现为花叶、叶片黄化、叶片畸形、叶片和果实坏死等症状。发病条件一般是有传播媒介即刺吸式口器的害虫，蚜虫，灰飞虱，白粉虱，烟粉虱等，也可农事操作传播。空气相对干燥有利于病毒病的发生。
辣椒病毒病症常见的有花叶、畸形、枯顶、条斑等。花叶型：病叶呈现浓绿与淡绿相间的花斑；皱缩、叶片畸型：初期由心叶叶脉褪绿，逐渐变为花叶皱缩，以后病叶增厚，叶缘向上卷曲形成斗状，幼叶狭窄或出现线状叶。后期植株上部明显丛簇状，节间缩短，植株矮化，重病果出现深绿相间的花斑，有疣状突起；条斑型：叶片主脉呈褐色或黑色坏死，逐渐扩展到侧枝、主茎及生长点，造成落花、落叶、落果，以至整株枯死。
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