病株叶片一般不表现特殊症状，仅仅由于失水而表现枯萎；但也有棉苗受害后，在子叶出现不规则黄褐色斑，最后病斑破裂穿孔。
加强田间管理时时观察病虫害发生定期喷药预防。
棉花立枯病是苗期的主要病害。
加强水肥管理，预防病虫害。
棉花播种后，种子萌动但还未出土之前，病菌便侵染地下的幼根、幼芽，造成烂种、烂芽。棉苗出土后，首先在接近地面幼茎基部出现症状，起先呈现黄褐色斑点，逐渐扩大，凹陷、腐烂，严重的可扩展到茎的四周，凹陷部位失水过多而呈蜂腰状，最后变黑褐色，棉苗枯死，病斑部位比炭疽病低。
棉花种植，加强田间管理，肥水一体化。
棉苗未出土前，立枯丝核菌可侵染幼根和幼芽，造成烂种和烂芽。棉苗子叶期最易感病，棉苗出土的1个月内如果土壤温度持续在15℃左右，或者遇到寒流、低温多雨，立枯病就会严重发生，造成棉苗死亡。若收花前低温多雨，棉铃受害，病菌还可侵入种子内部，成为下一年初次侵染的来源。在多雨的年份，现蕾开花期的棉株也可能发生立枯病，茎基部出现黑褐色病斑，表皮腐烂后，露出里面的木质纤维，严重的折断而死，发过病的部位有时呈瘤状。播种过早，气温偏低，棉花萌发出苗慢，病菌侵染时间长，发病重。
加强田间水肥管理及病虫害防治。
棉苗出土后，首先在接近地面幼茎基部出现症状，起先呈现黄褐色斑点，逐渐扩大，凹陷、腐烂，严重的可扩展到茎的四周，凹陷部位失水过多而呈蜂腰状，最后变黑褐色，棉苗枯死，病斑部位比炭疽病低。
喷15％粉锈灵可湿性粉剂1000倍液或75％百菌清可湿性粉剂800倍液。从发病初期开始，每星期喷1次，连续喷2～3次。
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